Taux d’absentéisme dans la fonction publique territoriale : panorama 2025
À l’occasion de la sortie de l’édition 2025 du Panorama sur la qualité de vie au travail et la santé des agents dans les collectivités territoriales, nos experts Relyens décryptent les taux d’absentéisme dans la fonction publique territoriale pour raison de santé en 2024.
Réalisé sur des tendances longues (5 et 10 ans), ce décryptage des absences permet d’en identifier les causes structurelles. Compte tenu de la réforme en cours sur la protection sociale complémentaire, nous avons également souhaité mettre en exergue la croissance des indicateurs concernant le passage à demi-traitement des agents.
Depuis 25 ans, le Panorama Qualité de vie au travail & santé des agents dans les collectivités territoriales constitue le baromètre de référence de la Fonction publique territoriale. Fondé sur les données de plus de 440 000 agents (près d’un quart de la FPT affiliée à la CNRACL), le Panorama 2025 fournit une lecture unique, basée sur l’année 2024.
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Quelles sont les grandes tendances de l’évolution de l’absentéisme dans la fonction publique territoriale ?
La principale tendance du taux d’absentéisme dans la fonction publique territoriale en 2024 est l’allongement de la durée moyenne des arrêts sur les cinq dernières années. On observe également une progression des absences en maladie ordinaire. Celles-ci s’inscrivent notamment dans un contexte de vieillissement de la population active des collectivités.
La hausse de la gravité des absences : une tendance forte
Ces dernières années, une des tendances lourdes des absences pour raison de santé que nous relevons est l’augmentation notable de la gravité dans les absences. Pour rappel, ce que nous entendons par gravité des arrêts est la durée des absences sur une période donnée. Pour en savoir plus sur le mode de calcul de la gravité des absences, vous pouvez consulter notre vidéo explicative.
| Evolution 2019/2024 | Maladie Ordinaire | Longue maladie / longue durée | Accident du travail | Absences globales |
| Gravité | +17% | +2% | +20% | +12% |
| Fréquence | -6% | +1% | -5% | -7% |
| Exposition | -4% | +1% | -4% | -6% |
| Taux d’absentéisme | +8% | -4% | +3% | +4% |
Les durées d’absence pour raison de santé ont progressé de 12 % en 5 ans. Elle s’explique notamment par le poids des longues maladies et des absences de longue durée, un des impacts majeurs du vieillissement de la fonction publique territoriale.
Il est intéressant de noter que si la durée des arrêts progresse, la fréquence affiche une baisse de 7 % en 5 ans (17 % en 10 ans) et l’exposition diminue également de 7 % en 5 ans (8 % en 10 ans).
Si les agents ne sont pas plus nombreux à s’absenter, ni plus souvent absents, ils le sont en revanche pour des durées d’arrêt plus longues. La gravité des absences constitue l’enjeu majeur pour les collectivités territoriales en matière de santé au travail.
L’étude sur 10 ans montre l’importante augmentation de la gravité (+ 51 % en passant à 53 jours en moyenne et la baisse de la fréquence (- 17 %).
De ce fait, le taux d’absentéisme dans la fonction publique progresse de 16 % sur cette période. La croissance de la gravité est le phénomène le plus important sur les 10 dernières années. Elle explique à elle seule la croissance du taux d’absentéisme.
Le taux d’absentéisme dans la fonction publique territoriale : nature des absences en 2024
En 2024, le taux d’absentéisme de la fonction publique territoriale (hors congé maternité) est quasiment similaire à celui de 2023 (9,7 % vs 9,8 %). Ce pourcentage qui peut sembler peu élevé, correspond pourtant à une moyenne de plus 9 agents sur 100 absents toute une année. Au niveau de la répartition par nature, on peut remarquer le poids très important de la maladie ordinaire (5,2 %).
Les absences en longue maladie/longue durée sont stables en termes de gravité. Toutefois, la fréquence et l’exposition sont en reprise depuis 2021 et ont rattrapé le taux de 2019.
Quant aux accidents du travail, le taux d’absentéisme dans le secteur public est en évolution de 3 % en 5 ans. Il est marqué par une baisse de l’exposition et de la fréquence cependant concernant la gravité celle-ci se stabilise marquant cependant une hausse de 20 % en 5 ans.
Focus sur les arrêts longs en 2024
Bien que le nombre total d’arrêts ait reculé sur les cinq dernières années, le relevé d’absentéisme dans la fonction publique montre une durée est de plus en plus longue. Depuis 2019, les arrêts longs ont augmenté de 12 % et regroupent la majeure partie des jours d’absence.
Tableau – Évolution 2019/2024 des arrêts et jours d’arrêt selon leur durée
| Maladie ordinaire | Arrêts de moins de 90 jours | Arrêts de 90 à 180 jours | Arrêts de 181 à 365 jours |
| Arrêts – 2019 | 92,2 % | 5,1 % | 2,7 % |
| Arrêts – 2024 | 90,8 % | 6,1 % | 3,1 % |
| Évolution arrêts | – 1,5 % | + 19,6 % | + 14,8 % |
| Jours – 2019 | 51,9 % | 22,3 % | 25,8 % |
| Jours – 2024 | 49,2 % | 24,0 % | 26,8 % |
| Évolution jours | – 5,2 % | + 7,6 % | + 3,9 % |
Du côté des maladies ordinaires, les absences de plus de 15 jours concentrent plus de 88 % des jours d’arrêt en 2024. Sur les 5 dernières années, les arrêts de 90 à 180 jours ont augmenté de plus de 19 % et ceux de 181 à 365 jours de près de 15 %.
Du côté des absences en longue maladie et longue durée, le taux d’absentéisme des collectivités territoriales est également en hausse. En 2024, la gravité globale des absences représentait 310 jours en moyenne.
Les maladies professionnelles présentent quant à elles une hausse de gravité de 17 % depuis 2019. Parmi celles-ci, 91 % sont dues à des troubles musculo-squelettiques (TMS). Dans les cas des accidents du travail, les arrêts longs, qui dépassent 90 jours, regroupent plus de 77 % des jours d’absence cumulés. Sur cinq ans, la durée moyenne des absences a augmenté de 20 %. En tout, les arrêts longs expliquent la progression de 4 % du taux d’absentéisme dans la fonction publique territoriale.
On constate également une hausse des coûts moyens des absences de longues durées et longues maladies. Depuis 2018, les coûts moyens progressent pour tout type d’arrêt, avec une augmentation de 17 % pour les longues maladies et longues durées. Toutefois, les coûts liés aux accidents du travail (+ 55 %) et aux maladies ordinaires (+ 50 %) restent en tête.
Les absences peuvent être réparties en trois grandes familles
- Les absences de courte durée qui représentent la plupart des absences en maladie ordinaire (43 % durent moins de 8 jours).
- Les arrêts de moins de 15 jours concentrent les deux tiers des absences, mais ne dépassent pas 12 % des jours d’absences.
- Les arrêts de plus de 15 jours, à l’inverse, bien que moins nombreux, totalisent plus de 88 % des jours d’arrêt.
- Ce dernier point plaide en faveur d’une couverture de prévoyance complémentaire pour protéger les agents des impacts financiers de la bascule à demi-traitement après 90 jours.
La prévoyance complémentaire, bien que souvent interprétée comme une couverture liée à des pathologies longues, concerne aussi la maladie ordinaire. Cette dernière concentre près de la moitié des jours d’absence indemnisés et les trois quarts des agents absents.
Absences de longue durée et limite statutaire
Depuis 20 ans, l’absentéisme des fonctionnaires est marqué par une hausse régulière des durées d’absence en longue maladie, en longue durée ou en maladie professionnelle. Depuis 2016, 30 % des longues maladies arrêts atteignent la limite statutaire de 3 ans. Pour ce qui est des arrêts de longue durée, ce sont 29 % qui atteignent systématiquement la limite de 5 ans. En 10 ans, la part des arrêts qui atteignent leur fin de droits statutaire est 25 % plus nombreuse.
Ces données s’expliquent par la nature des pathologies lourdes qui nécessitent des traitements plus longs et plus conséquents, tout en rendant le retour au travail plus difficile.
Âge et taux d’absentéisme dans la fonction publique territoriale
L’âge moyen dans la fonction publique territoriale est supérieur à ceux des autres fonctions publiques ou du secteur privé. Supérieur à 48 ans, il marque un vieillissement qui impacte la durée des absences. Plus de 6 agents sur 10 ont plus de 45 ans et les 55 ans représentent près de 3 agents sur 10.
Bien que les agents plus jeunes s’absentent plus fréquemment, ce sont les agents plus âgés qui connaissent les arrêts les plus longs. La gravité des arrêts triple entre les agents de 25 ans (23 jours) et ceux de 55 ans, qui s’étendent à 69 jours. Les logiques de prévention doivent donc s’adapter à la réalité de chaque catégorie d’âge.
Le taux d’absentéisme de la fonction publique territoriale expose plusieurs constats
- Les collectivités font face à une population marquée par le vieillissement de ses effectifs combiné à des métiers avec une forte usure professionnelle.
- Il est plus que jamais nécessaire d’anticiper et d’agir afin de sécuriser à long terme la délivrance des missions d’intérêt général que portent les acteurs territoriaux.
C’est pourquoi nous avons souhaité enrichir notre baromètre des absences pour raison de santé par une enquête sur les actions de prévention mises en place par les DRH dans leurs organisations.
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