Quel est le coût de l’absentéisme dans la fonction publique ?
Le taux d’absentéisme constitue aujourd’hui un enjeu majeur pour les employeurs publics, tant sur le plan financier que sur la continuité du service public. Longtemps abordé sous l’angle du nombre d’absences, il doit désormais être regardé sous l’angle de sa durée, de sa gravité et de ses impacts organisationnels.
Dans un contexte marqué par le vieillissement des effectifs, l’allongement des carrières et la progression des arrêts de longue durée, le coût de l’absentéisme dans la fonction publique tend à s’accroître. Il pèse durablement sur les budgets des collectivités et des établissements publics, tout en mettant sous tension les organisations et les équipes.
À partir des enseignements du panorama Relyens de 2025, observons l’évolution du coût de l’absentéisme, ses principaux déterminants et ses impacts économiques.
Depuis 25 ans, le Panorama Qualité de vie au travail & santé des agents dans les collectivités territoriales constitue le baromètre de référence de la Fonction publique territoriale. Fondé sur les données de plus de 440 000 agents (près d’un quart de la FPT affiliée à la CNRACL), le Panorama 2025 fournit une lecture unique, basée sur l’année 2024.
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Les différentes mesures de coût des absences
Le coût de l’absentéisme ne se limite pas seulement aux dépenses liées aux absences. Il demande à la fois d’absorber les coûts directs (rémunération, indemnisation) et les effets indirects sur le fonctionnement des services.
Pour en comprendre les impacts, l’analyse économique des absences repose sur des indicateurs précis, permettant de mesurer la fréquence, la gravité et l’exposition aux absences. Ces indicateurs de mesure des absences au travail constituent un socle essentiel pour piloter l’absentéisme dans la durée.
De plus, toutes les absences n’engendrent pas le même niveau de frais. Si les arrêts courts pèsent individuellement moins, leur répétition peut générer des désorganisations importantes et des coûts indirects importants. À l’inverse, les arrêts longs concentrent des impacts financiers plus élevés et contribuent fortement à l’augmentation du coût de l’absentéisme dans la fonction publique.
Quel est le coût moyen par agent employé en 2024 ?
En moyenne, le coût de l’absentéisme dans la fonction publique a représenté près de 2 400 euros par agent titulaire en 2024. Ce coût moyen rapporté à l’effectif d’un établissement permet d’exprimer le coût global des absences pour une année.
Le coût moyen par agent employé comprend les charges patronales, mais est calculé hors frais médicaux en accident du travail.
La maladie ordinaire représente la majeure partie des coûts, et son évolution est accentuée par la gravité des absences (durée). En effet, plus les absences sont longues, plus les coûts directs sont importants. De plus, ces frais peuvent également être majorés selon l’ancienneté et l’échelon des agents.
Des chiffres à la hausse
Depuis 2018, le coût moyen des absences a augmenté, quelle que soit la nature des arrêts. Les deux principaux moteurs ont été les accidents du travail (+ 55 %) et la maladie ordinaire (+ 50 %).
| Nature d’absence | Coût moyen d’un arrêt (en €) | Coût maximum (en €) |
| Maladie ordinaire | 1 643 € | 16 574 € |
| Maternité | 9 290 € | –* |
| Longue maladie / Longue durée | 52 184 € | – |
| – Longue maladie | 39 043 € | 53 184 € |
| – Longue durée | 82 115 € | 106 368 € |
| Accident du travail | 6 270 € | –** |
| – Accident de service | 4 608 € | –** |
| – Accident de trajet | 5 087 € | –** |
| – Maladie professionnelle | 28 492 € | –** |
Les arrêts de longue durée concentrent l’essentiel du coût de l’absentéisme pour les collectivités. Plus un arrêt se prolonge, plus son impact financier est élevé : un arrêt de longue durée représente en moyenne 82 115 € de coût direct, contre 39 043 € pour une longue maladie.
Parmi les arrêts liés aux accidents, les maladies professionnelles génèrent les coûts moyens les plus importants (28 492 € par arrêt), en raison de leur gravité et de leur lien direct avec l’activité professionnelle. À ces montants s’ajoutent des coûts différés, notamment les frais médicaux pouvant être pris en charge sur le long terme, y compris après la reprise ou le départ à la retraite.
* Ce coût maximum n’est pas calculable, car il est fonction du nombre d’enfants attendus et du nombre d’enfants du foyer.
** Ce coût maximum n’est pas calculable, car il est fonction notamment de la durée de l’arrêt principalement liée à la pathologie.
Pour conclure
Le coût de l’absentéisme constitue aujourd’hui un enjeu stratégique majeur pour les employeurs publics. De manière générale, la gravité croissante des arrêts et l’avancement de carrière des agents constituent les principaux moteurs de la hausse du coût de l’absentéisme dans la fonction publique, en particulier pour les arrêts de longue durée.
Dans ce contexte, seule une approche globale, combinant analyse fine des indicateurs, prévention de l’usure professionnelle et accompagnement des parcours, permet d’agir durablement sur les causes de l’absentéisme et d’en maîtriser les impacts financiers et organisationnels.
Pour en apprendre plus sur les chiffres et les mesures préventives à mettre en place pour faire face à ces enjeux, découvrez le panorama Relyens de 2025.
